もしものために、ログインの少ない場合には作業が終わったらもう一度ログインでサーバーに作業が保存されます。時折サーバーが停止したり、セーブデータが破損する事もあるので、最後の人はやった方がいいです。
ログイン直後に止まってるとき、操作をすると動き出したときに一気に操作が反映されることから切断されることがあります。操作をするなら動き出すのを待ってからを心がけてください。
ログインした後に一時停止せずに動き出す人は最初のうち、早送りで同期をとろうとします。この早送りの最中も操作をするとラグが発生して同期がとれなくなることが多い気がします。
また各clientの転送速度やロード速度によってサーバーから後れをとることで同期が取れにくくなりますが、それは今のところそういう仕様であるとしか言えません。